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Dans cette étape, nous allons configurer MySQL pour que l’engine par défaut soit InnoDB, car celui-ci est MyIsam, tout nous devons supprimer les fichiers logs de mysql et modifier le fichier de configuration my.cnf pour linux même chose pour windows avec son fichier my.ini, pour ceux qui n'ont pas encore installer MYSQL

//supprimer les fichiers logs dans le repertoire apres avoir stopper le service mysql
/etc/init.d/mysql stop
rm /var/lib/mysql/ib_logfile*

ensuite placez vous dans le répertoire du fichier de configuration de mysql, puis modifier le
cd /etc/mysql
gedit my.cnf

plus d'explication sur le site de MYSQL puis à l'endroit ou vous apercevrez skip InnoDB vous mettrez à la ligne

default-storage-engine=INNODB
innodb_data_file_path = ibdata:10M:autoextend
set-variable = innodb_buffer_pool_size=100M
set-variable = innodb_additional_mem_pool_size=40M
set-variable = innodb_log_file_size=20M
set-variable = innodb_log_buffer_size=8M
innodb_flush_log_at_trx_commit=1

puis démarrez le serveur mysql